Constitui apoio importante no diagnóstico por imagem das diversas patologias cardíacas e vasculares que são tratadas na FBC. Este Setor conta com aparelhos de última geração capazes de realizar avaliações ecocardiográficas variadas, que caracterizam os recursos diagnósticos neste âmbito. O Setor também realiza ecocardiogramas por via transesofágica, com a utilização de constrastes e sob estresse.