A unidade destaca-se pela sua especialização em cirurgias de alta complexidade, contando com a atuação de médicos e profissionais de saúde com larga experiência.
Além de atuar em todo espectro cirúrgico das cardiopatias, ênfase especial tem sido dedicada às inovações tecnológicas no tratamento cirúrgico das cardiopatias isquêmicas e das patologias da aorta torácica. Em relação às patologias da aorta torácica, destacamos o tratamento cirúrgico de aneurismas e disseções agudas da aorta.
No que se refere ao tratamento cirúrgico das cardiopatias isquêmicas, a revascularização miocárdica sem o uso da circulação extracorpórea passou a ser a técnica de escolha devido aos melhores resultados oferecidos pela mesma. Neste procedimento realiza-se a revascularização miocárdica com o coração batendo e com o auxílio de um estabilizador tecidual. A FBC tem o maior número de pacientes operados através dessa técnica no Norte-Nordeste.