Inaugurada em 24 de outubro de 1990, ao longo de seus vinte anos de existência, a FBC tem contribuído significativamente para a visibilidade da cardiologia da Bahia no âmbito nacional e internacional, pelo trabalho que realiza na assistência, ensino, pesquisa e extensão.

O ano de 2005 representou um marco significativo para a FBC e uma evidência de seu crescimento e maturidade. Instalada em sua nova sede, a FBC hoje é totalmente equipada com o que há de mais moderno e se consolida como um centro de referência em Cardiologia, oferecendo os mais avançados procedimentos no tratamento de doenças cardiovasculares com padrão de excelência comparável ao dos melhores centros do país. Para isso a FBC dispõe de um corpo clinico altamente qualificado com 70 cardiologistas, 13 médicos estagiários e 29 enfermeiras, além de uma equipe de apoio com 176 profissionais.

Em 2006 o Pronto Atendimento (PA) da FBC foi ampliado passando a oferecer novos leitos.

No inicio de 2007 a FBC reformou parte das suas instalações para melhor atender seus pacientes. No Setor de Ecocardiograma e no Setor de Ergometria foram adquiridos novos aparelhos. A recepção do térreo se tornou mais ampla e confortável, sendo criado também, um balcão de informações para prestar ajuda e esclarecimentos aos pacientes e acompanhantes.

Em fevereiro de 2008 foi inaugurada mais uma unidade de internamento na FBC, que foi cuidadosamente preparada para oferecer mais comodidade e conforto aos seus pacientes.